Systems biology short course : Integration of multi-omics data for biomedical and nutritional applications

Le cours se concentrera sur l'approche de reconstruction et d'analyse basées sur les contraintes (COBRA) et son utilisation pour la contextualisation des données omiques à haut débit (transcriptomique, protéomique, métabolomique, métagénomique) dans la recherche biomédicale. COBRA est une méthode de biologie des systèmes informatiques qui utilise des reconstructions à l'échelle du génome pour faire des prédictions détaillées, mécanistes et spécifiques au contexte sur les états métaboliques d'un organisme cible et qui permit des simulations spécifiques à l'individu, spécifiques aux tissus et spécifiques à la condition d'un sujet. Les données métagénomiques permettent de construire des modèles communautaires spécifiques à l'échantillon du microbiome. Les modèles spécifiques à l'échantillon permettent de stratifier, par exemple, les patients et les témoins en fonction de leurs différences métaboliques, et de prédire les résultats des interventions ou des perturbations basées sur les nutriments. Par conséquent, l'approche COBRA a des applications précieuses pour le développement de la médecine de précision ou des interventions médicales adaptées à l'individu.